Proteomická Laboratoř
Oddělení Analýzy fyziologicky aktivních látek Fyziologického ústavu AVČR, v.v.i.

Kontakt E-mail: miksikbiomed.cas.cz


Prováděné proteomické analýzy:

  • Proteomická analýza tkáně (využívající 1D a 2D elektroforézu ve spojení s nanoLC a MS)
  • Cílená analýza proteinů/peptidů (spoty apod.)
  • Určení specifických proteinů/peptidů ve vzorcích (tkáních apod.) včetně stanovení analýzy změn jejich zastoupení
  • Analýza posttraslačních modifikací proteinů/peptidů (např. glykace apod.)



    Jiné analýzy využívající elektroforetické (2D, 1D, IEF, kapilárně elektromigrační), chromatografické (HPLC, nanoLC) a MS metody (příklady):

  • Analýza aminokyselin (volných i vázaných v proteinech)
  • Analýza steroidů (a steroidního metabolismu)
  • Analýza pigmentů
  • Analýza léčiv
  • atd., atd. (záleží na domluvě - možnosti jsou široké!)

    Metody:

    Příprava vzorku:

  • Extrakce na SPE kolonkách (např. metabolické studie)
  • Extrakce na špičkách Zip-Tip (např. analýza proteinů/peptidů)
  • Extrakce kapalina-kapalina (např. analýza pigmentů)
  • Derivatizace (např. analýza aminokyselin, oxo-reaktivních látek)
  • Štěpení proteinů v gelu (SDS-PAGE nebo 2D-PAGE) trypsinem po obarvení Coomassie Blue (návod)

    Analytické metody:

    Plošná elektroforéza (SDS-PAGE, IEF, 2D), dokumentace gelů (skenery)

    Podrobné informace

    MaXis - high-resolution tandem mass spectrometry (Q-TOF) (Bruker Daltonics)

    EASY-nLC - nanoLC system

    Proteomic software (Proteinscape)

    Podrobné informace

    Fotografie ze stěhování a instalace Q-TOF MaXis Q-TOF MaXis

    Hewlett-Packard (Agilent) HPLC 1100 System. HPLC systém: degasér, binární pumpa, autosampler, termostatovaná kolona. Detektory: DAD, fluorescenční, radioaktivní (s pevnou i průtokovou scintilační celou), evaporative light-scattering detector

    Bruker HCTultra ETD II

    Proteomic software

    CE-MS coupling (Beckman P/ACE 5000 and Agilent MSD 1100)

    Kapilární elektroforéza: Agilent 7100 s DAD detektorem a možností spojení s MS

    Capillary electrophoresis: two systems by Beckman (5500 and 5000) with three detectors: UV, DAD and LIF (laser-induced fluorescence).



    Příklady publikačních výstupů!






    Fotografie ze stěhování a instalace Q-TOF MaXis Q-TOF MaXis

    Last update: June 20, 2015