Proteomická Laboratoř
Oddělení Translační metabolismus (dříve Analýza fyziologicky aktivních látek) Fyziologického ústavu AVČR, v.v.i.
Kontakt E-mail: Ivan.Miksik
fgu.cas.cz
Vzhledem k zrušení stále funkčního hmotnostního spektrometru (MaXis Q-TOF) k 12. 2022 nebudou prováděny již žádné proteomické analýzy
Omluváme se za tuto událost, kterou nelze změnit/ovlivnit.
Prováděné proteomické analýzy:
Proteomická analýza tkáně (využívající 1D a 2D elektroforézu ve spojení s nanoLC a MS)
Cílená analýza proteinů/peptidů (spoty apod.)
Určení specifických proteinů/peptidů ve vzorcích (tkáních apod.) včetně stanovení analýzy změn jejich zastoupení
Analýza posttraslačních modifikací proteinů/peptidů (např. glykace apod.)
Jiné analýzy využívající elektroforetické (2D, 1D, IEF, kapilárně elektromigrační), chromatografické (HPLC, nanoLC) a MS metody (příklady):
Analýza aminokyselin (volných i vázaných v proteinech)
Analýza steroidů (a steroidního metabolismu)
Analýza pigmentů
Analýza léčiv
atd., atd. (záleží na domluvě - možnosti jsou široké!)
Metody:
Příprava vzorku:
Extrakce na SPE kolonkách (např. metabolické studie)
Extrakce na špičkách Zip-Tip (např. analýza proteinů/peptidů)
Extrakce kapalina-kapalina (např. analýza pigmentů)
Derivatizace (např. analýza aminokyselin, oxo-reaktivních látek)
Štěpení proteinů v gelu (SDS-PAGE nebo 2D-PAGE) trypsinem po obarvení Coomassie Blue (návod)
Analytické metody:
Plošná elektroforéza (SDS-PAGE, IEF, 2D), dokumentace gelů (skenery)
Podrobné informace
MaXis - high-resolution tandem mass spectrometry (Q-TOF) (Bruker Daltonics)
EASY-nLC - nanoLC system
Proteomic software (Proteinscape)
Podrobné informace
Fotografie ze stěhování a instalace Q-TOF MaXis Q-TOF MaXis
Hewlett-Packard (Agilent) HPLC 1100 System.
HPLC systém: degasér, binární pumpa, autosampler, termostatovaná kolona. Detektory:
DAD, fluorescenční, radioaktivní (s pevnou i průtokovou scintilační celou), evaporative light-scattering detector
Bruker HCTultra ETD II
Proteomic software
CE-MS coupling (Beckman P/ACE 5000 and Agilent MSD 1100)
Kapilární elektroforéza: Agilent 7100 s DAD detektorem a možností spojení s MS
Capillary electrophoresis: two systems by Beckman (5500
and 5000) with three detectors: UV, DAD and LIF (laser-induced fluorescence).
Příklady publikačních výstupů!
Fotografie ze stěhování a instalace Q-TOF MaXis Q-TOF MaXis
Last update:
December 6, 2022
Prováděné proteomické analýzy:
Proteomická analýza tkáně (využívající 1D a 2D elektroforézu ve spojení s nanoLC a MS)
Cílená analýza proteinů/peptidů (spoty apod.)
Určení specifických proteinů/peptidů ve vzorcích (tkáních apod.) včetně stanovení analýzy změn jejich zastoupení
Analýza posttraslačních modifikací proteinů/peptidů (např. glykace apod.)
Jiné analýzy využívající elektroforetické (2D, 1D, IEF, kapilárně elektromigrační), chromatografické (HPLC, nanoLC) a MS metody (příklady):
Analýza aminokyselin (volných i vázaných v proteinech)
Analýza steroidů (a steroidního metabolismu)
Analýza pigmentů
Analýza léčiv
atd., atd. (záleží na domluvě - možnosti jsou široké!)
Metody:
Příprava vzorku:
Extrakce na SPE kolonkách (např. metabolické studie)
Extrakce na špičkách Zip-Tip (např. analýza proteinů/peptidů)
Extrakce kapalina-kapalina (např. analýza pigmentů)
Derivatizace (např. analýza aminokyselin, oxo-reaktivních látek)
Štěpení proteinů v gelu (SDS-PAGE nebo 2D-PAGE) trypsinem po obarvení Coomassie Blue (návod)
Analytické metody:
Plošná elektroforéza (SDS-PAGE, IEF, 2D), dokumentace gelů (skenery)
Podrobné informace
MaXis - high-resolution tandem mass spectrometry (Q-TOF) (Bruker Daltonics)
EASY-nLC - nanoLC system
Proteomic software (Proteinscape)
Podrobné informace
Fotografie ze stěhování a instalace Q-TOF MaXis Q-TOF MaXis
Hewlett-Packard (Agilent) HPLC 1100 System.
HPLC systém: degasér, binární pumpa, autosampler, termostatovaná kolona. Detektory:
DAD, fluorescenční, radioaktivní (s pevnou i průtokovou scintilační celou), evaporative light-scattering detector
Bruker HCTultra ETD II
Proteomic software
CE-MS coupling (Beckman P/ACE 5000 and Agilent MSD 1100)
Kapilární elektroforéza: Agilent 7100 s DAD detektorem a možností spojení s MS
Capillary electrophoresis: two systems by Beckman (5500
and 5000) with three detectors: UV, DAD and LIF (laser-induced fluorescence).
Příklady publikačních výstupů!
Fotografie ze stěhování a instalace Q-TOF MaXis Q-TOF MaXis
Last update:
December 6, 2022
Jiné analýzy využívající elektroforetické (2D, 1D, IEF, kapilárně elektromigrační), chromatografické (HPLC, nanoLC) a MS metody (příklady):
Analýza aminokyselin (volných i vázaných v proteinech)
Analýza steroidů (a steroidního metabolismu)
Analýza pigmentů
Analýza léčiv
atd., atd. (záleží na domluvě - možnosti jsou široké!)
Metody:
Příprava vzorku:
Extrakce na SPE kolonkách (např. metabolické studie)
Extrakce na špičkách Zip-Tip (např. analýza proteinů/peptidů)
Extrakce kapalina-kapalina (např. analýza pigmentů)
Derivatizace (např. analýza aminokyselin, oxo-reaktivních látek)
Štěpení proteinů v gelu (SDS-PAGE nebo 2D-PAGE) trypsinem po obarvení Coomassie Blue (návod)
Analytické metody:
Plošná elektroforéza (SDS-PAGE, IEF, 2D), dokumentace gelů (skenery)
Podrobné informace
MaXis - high-resolution tandem mass spectrometry (Q-TOF) (Bruker Daltonics)
EASY-nLC - nanoLC system
Proteomic software (Proteinscape)
Podrobné informace
Fotografie ze stěhování a instalace Q-TOF MaXis Q-TOF MaXis
Hewlett-Packard (Agilent) HPLC 1100 System.
HPLC systém: degasér, binární pumpa, autosampler, termostatovaná kolona. Detektory:
DAD, fluorescenční, radioaktivní (s pevnou i průtokovou scintilační celou), evaporative light-scattering detector
Bruker HCTultra ETD II
Proteomic software
CE-MS coupling (Beckman P/ACE 5000 and Agilent MSD 1100)
Kapilární elektroforéza: Agilent 7100 s DAD detektorem a možností spojení s MS
Capillary electrophoresis: two systems by Beckman (5500
and 5000) with three detectors: UV, DAD and LIF (laser-induced fluorescence).
Příklady publikačních výstupů!
Fotografie ze stěhování a instalace Q-TOF MaXis Q-TOF MaXis
Last update:
December 6, 2022
Metody:
Příprava vzorku:
Analytické metody:
|
|
Plošná elektroforéza (SDS-PAGE, IEF, 2D), dokumentace gelů (skenery)
|
|
MaXis - high-resolution tandem mass spectrometry (Q-TOF) (Bruker Daltonics)
EASY-nLC - nanoLC system Proteomic software (Proteinscape) Podrobné informace Fotografie ze stěhování a instalace Q-TOF MaXis Q-TOF MaXis |
|
|
Hewlett-Packard (Agilent) HPLC 1100 System.
HPLC systém: degasér, binární pumpa, autosampler, termostatovaná kolona. Detektory:
DAD, fluorescenční, radioaktivní (s pevnou i průtokovou scintilační celou), evaporative light-scattering detector
|
|
|
CE-MS coupling (Beckman P/ACE 5000 and Agilent MSD 1100) |
|
|
Kapilární elektroforéza: Agilent 7100 s DAD detektorem a možností spojení s MS |
|
|
Capillary electrophoresis: two systems by Beckman (5500 and 5000) with three detectors: UV, DAD and LIF (laser-induced fluorescence). |
Příklady publikačních výstupů!
Fotografie ze stěhování a instalace Q-TOF MaXis Q-TOF MaXis
Last update: December 6, 2022